A l’assemblée des membres de la Fondation Hanns Seidel siègent au maximum 40 personnes qui élisent un président dans leurs rangs.

L’unité organisationnelle Tâches centrales comprend les domaines Relations presse et Relations publiques, les RH Allemagne et étranger, le Budget et les Finances, ainsi que le domaine Achats. A ces domaines viennent s’ajouter les centres éducatifs de Wildbad Kreuth, du monastère de Banz et le Centre de conférences de Munich, le bureau de Berlin ainsi qu’un état-major s’occupant des affaires de la présidence, des relations étrangères et des bureaux de liaison.